2009年11月27日，中国科学技术信息研究所公布了2008年度我国发表科技论文统计结果，四川大学华西医院2008年发表科技论文在被SCI（364篇）、MEDLINE（571篇）收录和表现不俗论文（31篇）三项指标中名列医疗机构第一，在国内论文总数（1969篇）中排名第二，在论文被引用次数（6817次）中排名第三；这是华西医院继2005年和2007年SCI、MEDLINE收录论文在医疗机构双双名列第一，其他各项指标连续多年名列医疗机构前茅之后的又一次大面积丰收；为四川大学发表科技论文统计数据排名大幅度上升作出了突出贡献。
        作为科研产出权威数据中心，中国科学技术信息研究所公布的科技论文统计数据历来为科研单位所重视。10多年来，华西医院在这个统计数据表中的位置保持着强劲上升态势，论文数量持续增长、质量不断提升、排名逐渐靠前，越来越多的项目名列前茅，多个指标排名第一，还和第二名的距离逐渐拉大。截止2009年11月，来自华西医院内部的统计数据显示，2009年华西医院发表SCI论文已经超过430篇。这表明，四川大学华西医院的科技发展正以稳健的步伐走在中国医学界的前列。
这种逐渐增强、稳步上升的态势引起了同行关注，人们不禁要问：华西医院到底是怎么做到的？
对此，院长石应康深有感触的告诉记者：20年前的华西医院虽然也有名，但少见于经传，国内有同行甚至不知华西医院在重庆还是在成都。10多年前，在高校211工程评审中，有专家对华西医院的评价是，整体水平很高，但缺标志性的亮点；是无国家重点学科、无国家重点实验室、无两院院士的“三无”医院。
        面对这样的局面和评价，华西医院领导班子解放思想、转变观念、立志改革、锐意进取，决心率领华西医院在科技发展上打一个翻身仗。在上世纪90年代中期，他们制定了“医疗立院、教学兴院、科技强院，建设研究型医院和医学院”的发展思路。经过十几年的不懈努力，已经逐步形成有资源、有基地、有队伍、有方向的“四有”优势，科研实力和科技产出呈现强劲增长态势。
        在资源优势方面，华西医院作为中国规模最大的医院，有开放床位4300张，2008年门诊量255.6万人次，出院病人12.3万人次，手术6.7万台次，是西部地区的疑难重症诊疗中心。丰富的临床问题和病种，有科学价值的疾病标本，以及庞大的逐渐完善的临床数据库，既是医学研究的目标、对象和源动力，也是科技发展重要资源；为此华西医院确定了“以临床应用为导向，以解决临床实际问题为核心，开展临床研究、临床与基础结合研究和基础研究”的工作方针；逐步形成了若干独具特色的学科群，成功建设9个国家重点学科，不仅一举摘掉了“无国家重点学科”的帽子，还在教育部2008年临床医学一级学科评审中名列全国第五。与此同时，医疗服务产生的经济效益也为医院加大科研投入、发展科技提供了可靠的资金保障。
在基地建设方面，2002年以来，医院先后投入资金数亿元用于科研基地建设，在2005年建成了占地面积100亩、一期工程建筑面积28000平米，仪器设备价值过亿的科技园区，从而完成了华西医院科技发展空间的战略集结，而当时这样规模的科研基地在我国医院中绝无仅有。目前科技园区建有29个中心开放实验室，其中包括1个国家重点实验室，2个部级重点实验室，有上百位高级职称专兼职科研人才和上千名研究生在此从事科学研究。先进的科研仪器设备、开放的科研平台、共享的技术资源、科学的管理，为科研团队提供了理想的研究平台。
        在队伍建设方面，华西医院围绕科技强院的目标，推行内部培养和外部引进相结合的机制。通过临床高级医师专病化培养，专科医师、博士后、住院医师、技师、药师及护师规范化培养的内部人才培养方式，培养了大批优秀人才，科研人才梯队逐渐形成。人才引进方面，华西医院用正确的价值观导向，克服近亲繁殖、内外难以融合的缺点，培育尊重人才、包容人才、鼓励人才的团队氛围，弘扬海纳百川和团结奋进的医院文化，引进了大批优秀人才；从1994年到现在，先后有63位海内外高水平人才凝聚到华西旗下。
        经过内培外引，华西医院现有中国科学院院士1名、国家级教学名师2名，自然科学基金杰出青年人才基金获得者11名；高级职称在职人员558人，其中博士生导师165、硕士生导师 325人；有国家自然科学基金“创新研究群体”1个，教育部科技创新团队2个。此外，还有在站博士后45名，在读博士研究生472人、硕士研究生1012人、8年制医学生455人、7年制医学生232人作为科技后备人才。如此规模的人才队伍体系，为华西医院的科技发展提供了充分的人才资源。
        在科研方向方面，华西医院瞄准国际研究前沿，以临床应用为导向，倡导和促进学科交叉融合，凝练新的科学研究方向。在学科交叉过程中，首先从院内临床三级学科交叉开始，在此基础上促进二级学科和一级学科间的交叉，进一步拓展到四川大学相关学院和大学以外的科研院所。交叉学科之间提倡以临床应用研究为主导的基础与临床结合，利用综合性大学的优势，组织优势方向，建立交叉团队，吸引全院参与。医院现有三个一级新兴交叉学科研究中心：即人类疾病生物治疗研究中心、生物材料与生物力学临床应用工程技术研究中心、再生医学研究中心。逐步形成了基因组与蛋白质组、重大疾病分子机制、肿瘤疾病生物治疗、神经疾病与麻醉学、干细胞与组织工程、器官移植与免疫学、影像学与诊断治疗、生物医学功能材料、再生医学、中药机理与评价学、循证医学与数据库等10多个特色优势研究方向；在建设国家实验室目标的带动下，逐步形成国内大型的医学科技创新基地、综合性学科交叉平台与高效的成果转化中心。
        正因为如此，华西医院的科技发展才突飞猛进，成果也正在陆续表达，而科技论文产出只是其中之一。面对已经取得的成绩，石应康院长谦逊地说：“华西医院科技发展从‘三无’到‘四有’的转变，表面上是管理措施、基本条件的改变，更深层次的原因是价值观、精神和文化的正确引领，而这才是我们坚持和看重的。