华西医院实验医学科于2003年整合组建成立，是我国最先实现临床检验所有专业全面整合并提供临床各项检验的科室。成立时由临床生化室、临检与血液室、临床微生物室、临床免疫室、临床分子诊断室和输血与血库室六个亚专业实验室构成。于2010年以优异的成绩获评卫生部临床重点检验专科。