成都华西精准医学产业技术研究院有限公司
ctDNA全基因组甲基化测序及探针合成服务项目招标公告
根据业务需要，成都华西精准医学产业技术研究院有限公司按照公开、公平、公正原则，通过招标方式，择优选择一家服务商，提供ctDNA全基因组甲基化测序及探针合成服务项目服务。现将有关事项公告如下：
一、基本情况
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司（以下简称“公司”）于2017年5月27日在成都市天府新区正式注册成立。公司由四川大学华西医院牵头建设，华西医院指定四川华西健康科技有限公司,成都市政府指定成都科技服务集团有限公司，两方共同出资成立。
二、项目概况
2.1项目名称：成都华西精准医学产业技术研究院有限公司采购ctDNA全基因组甲基化测序及探针合成服务项目服务。
2.2 项目要求
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序号 |
物资 名称 |
工作内容、检测项及质量标准 |
最高限价 （万元/含税） |
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1 |
ctDNA 全基因组甲基化测序服务 |
一．概况 前期研究成果中发现肺癌血浆DNA携带特异性的甲基化变异，具有区分肺癌患者血浆与正常人或良性肺结节患者血浆样本的潜力。希望通过ctDNA全基因组甲基化测序，找到目标靶点，做为开发相关检测技术的必要基础。
二．平台 在高通量测序平台上完成。
三．质控要求 可检测10-20 ng左右的DNA； 能够对基因组内主要CpG island区域进行较为深度的测序； 最多一次可检测人类基因组300万个CpG位点上的甲基化水平，其中平均测序深度大于10x的CpG位点一般不低于80万个； 样本间检测区域一致性（即稳定检测相同的CpG区域）达到75%。
四．分析内容 1、用DNA甲基化单倍体型承载量(Methylation Haplotype Load)的定量指标，用来区分多种DNA甲基化模式； 2、筛选出肺癌或良性肺组织特异性的甲基化位点和区域，作为后续靶向检测技术的检测靶点；
五．服务能力 1、技术支持团队在甲基化研究领域类似项目经验 2、可协助进行课题设计、数据分析整理等工作；
六．结果交付： 1000例样本以上测序数据及分析结果。预期对良性和恶性肺结节的总体区分准去率达到90%，其中对早期恶性结节(长径小于30 mm，无转移)准确率达到80%。 |
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2 |
探针合成服务 |
概况 基于前期研究的成果，定制自主发现的肺癌特异性的DNA靶点的捕获法探针panel。对筛选出的甲基化位点进行进一步分析，基于甲基化单倍型信息筛选出肺癌特异性甲基化位点和区域，作为捕获法检测的靶点。
二．平台 基于硅基的DNA合成平台、根据序列的复杂程度通过人工智能的准确计算与分析，根据工程优化原理使用“设计、合成、测试、学习”的流程优化改进，合成出高保真、高效率的DNA捕获探针。
三．质控要求 CT转化率≥99.5%； 靶点检测灵敏度达到1/1000； 平均测序深度达到1000x 对高GC含量的区域（GC含量>60%，包含大量CpG岛等重要的甲基化功能区域）的测序结果质量好，高GC区平均测序深度不低于所有靶点平均深度的70% 脱靶率低于10% |
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2.3 交付时间：一个月内
2.4 资金来源：成都市财政经费。
三、投标申请人资格要求
参与本次招标服务商需符合以下条件：
（一）在中华人民共和国境内注册，遵守国家相关的法律法规政策，信誉良好，近三年无重大事故和不良行为记录；
（二）具有独立法人资格，具有企业法人营业执照、组织机构代码证和税务登记证（三证合一的提供营业执照）；
（三）具备售后服务和技术支持团队。
四、招标办法
本项目按照国家政府采购相关政策，采用“综合评分法”，由招标委员会对通过资格审查的投标申请人，按照评分由高到低的顺序，确定1—3名中选候选人。
五、招标材料领取截止时间及地点
凡有意且满足申请人资格要求的，请于2022年6月23日至2022年6月29日（上午8时30分至12时00分，下午14时00分至17时30分），通过以下方式领取招标文件。
电子邮件发送。请将单位介绍信、身份证复印件、及企业营业执照副本复印件加盖公司鲜章后扫描发送至邮箱hxjzcyyhr@163.com，通过我司审核的单位，我司将于3个工作日内予以回复。
注意：请务必按招标文件要求准备并提交投标材料，逾期未领取招标材料或未提交投标材料的，视为无参与招标意向或放弃参选。本次招标不收取任何费用，投标机构准备招标文件、出席招标会的交通费等费用由投标机构自理。
六、 发布公告的媒介
四川大学华西医院（http://www.wchscu.cn/）
成都华西精准医学产业技术研究院有限公司（http://www.hxjzyx.com/）
