1995年四川省第二批重点学科：眼科学、精神病学与精神卫生学。

1999年四川省第三批重点学科：骨外、肿瘤学。

2004年四川省第四批重点学科：消化系病、传染病、内分泌与代谢病、神经病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、胸心外科学、神经外科学、麻醉学、循证医学、中西医结合临床。

2005年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：血液内科、心血管内科。

2006年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：老年医学、康复医学、护理学。

2007年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：肾脏内科。

2008年四川省一级学科省级重点学科：临床医学、中西医结合。

2009年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：泌尿外科。

2013年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：临床药学。

2015年四川省卫生厅批准四川省医学重点学科：医学遗传学。