研究方向：

    A.    基于生物信息学对癌症等恶性疾病的多组学研究

    B.    无创液体活检手段开发

    C.    三代测序技术开发与应用

    D.   单细胞测序技术开发与应用

科室简介：

    本实验室主要致力于组学技术、液体活检技术、单细胞测序的新实验方法以及对应人工智能算法的开发、综合应用统计分析模型对疾病与肿瘤的基因组、转录组、表观遗传组等多组学高通量测序数据进行联合分析，深度挖掘疾病检测相关标志物，开发高效的肿瘤检测与监控新方法。

研究人员、研究方向简介

（1）主任：谢丹

研究方向：

1、      生物信息学，高通量组学技术，多组学数据分析

2、      开发高通量，高解析度的单细胞多组学复合测序技术

3、      单细胞测序技术研究肿瘤发生、发展和耐药等分子机制

4、      无创液体活检诊断技术开发和转化

5、      三代测序技术开发和应用

（2）研究人员

姓名：屠凯岭

研究方向：

1、      基于三代测序及单细胞测序技术的生物信息学工具开发；

2、      利用多组学数据整合探索肿瘤功能基因组调控网络；

姓名：夏林

研究方向：

1、      结合二代、三代以及光学图谱等多测序平台开发生物信息学方法识别多种癌症的结构变异，并结合多组学对癌症结构变异引起的基因表达调控紊乱事件进行探究

2、      基于基因组或cfDNA 表观遗传学数据对包括糖尿病与多类癌症在内的疾病进行健康状态监测，以期实现早期诊断与疾病状态监测。

姓名：张俊

研究方向：

1、  多组学液体活检技术在泛肿瘤早筛、诊断、预后及用药指导领域的应用研究

2、  基于cfDNA、cfRNA等，使用NGS或三代测序的病原微生物检测方法研究

姓名：杜杨

研究方向：

基于三代纳米孔测序平台单细胞或者少量细胞全基因组扩增技术研发；

姓名：鲁克莹

研究方向：

1、  基于三代测序技术及靶向测序技术的生物信息学研究

2、  整合多组学数据探索肿瘤功能基因组调控网络；

姓名：王欢

研究方向：

1、  基于三代测序的感染病快速检测；

2、  利用多组学数据整合探索肿瘤功能基因组调控网络；

姓名：曾天府

研究方向：

1、  基于三代测序技术的生物信息学工具开发；

2、  肿瘤基因组的多组学分析；

姓名：薛刚

研究方向：

1、  基于三代测序技术研究癌症的结构变异；

2、  基于多组学数据研究复杂疾病的发生发展分子机制，并用于指导药物的发现。

姓名：张加勋

研究方向：

基于三代纳米孔测序平台单细胞或者少量细胞全基因组扩增技术研发；

姓名：张琦琳

研究方向：

1、  基于三代测序及单细胞测序技术的生物信息学工具开发；

2、  利用单细胞转录组数据整合探索非小细胞肺癌功能基因组调控网络；

姓名：陈潇

研究方向：

1、  基于三代纳米孔测序技术的靶向测序技术研发；

2、  基因组开放区域研究；

姓名： 皮雪楠

研究方向：

1、  基于二代测序数据的幽门螺旋杆菌群体进化及性状研究；

2、  基于血液甲基化以及免疫组库的精神分裂症机制研究

姓名：李雪梅

研究方向：

结合三代纳米孔测序技术，发展相关的高通量测序技术体系，用以检测基因组结构变异、染色质开放性等等，并在此基础上探索肿瘤发生的分子基础。

姓名：魏冉磊

研究方向：

1、  基于转录组的二代和三代测序；

2、  生物信息数据库开发；

姓名：余春燕

研究方向：

基于单细胞转录组数据分析、探索细胞免疫微环境变化，进一步探索相关发病机制；

姓名：李璐璐

研究方向：

1、  多组学液体活检技术在泛肿瘤早筛、诊断、预后及用药指导领域的应用研究；

2、  基于cfDNA、cfRNA等，使用NGS或三代测序的病原微生物检测方法研究；

特色平台/设备

测序平台/设备：

    本实验室拥有集样品处理、文库构建、上机测序于一体的高通量测序平台，包括区域分隔的样品处理间、文库构建负压室，LabChip GX Touch 24 生物大分子分析仪，Covaris M220超声波破碎仪，MinION三代测序仪等，为测序技术开发、肿瘤基因组学研究提供了有力的硬件支持。

计算与存储平台：

    存储服务器由亚马逊云存储与本地存储服务器组成，存储空间超过700T；计算集群包括两台 GPU 计算节点服务器与35 台高性能 CPU 计算节点服务器，可使用核心数超过3000 个 CPU，拥有16块高性能显卡，以上高性能计算集群及存储服务器足以支持大规模测序数据的比对、组装、修饰识别等生物信息学分析工作。

位置：成都市高新区新川路 2222 号 D5B 栋 7 楼

联系方式：408444991@qq.com