1953年全国高等学校院系调整,华西大学更名“四川医学院”,由综合性大学改组为多专业的医药院校,设医学、口腔、卫生、药学4系及综合性附属医院1所。医学院改为医疗系,1965年改称医学系。同时,通过对华西协合大学各教学医院的合并和调整,位于国学巷的附属医院得到充实、完备,发展成为一家大型综合性教学医院,改名四川医学院附属医院,老百姓简称川医。
从1951年开始,中国政府提出,要系统地移植苏联的教育模式,按照苏联的高等教育集权管理、高等教育国有体制和高度分工的专门教育体系来构建中国的高教制度。