2000年以来，医院在建设病房大楼和门诊大楼过程中，在国内率先打破以内外科治疗手段来分配医疗空间的传统方式，把相关学科安排在相邻近的建筑空间之内，从空间上完成了病房和门诊按系统疾病为中心的集结。从此，内科、外科大楼的名称在华西医院成为历史。这种医疗空间的分配有效地推进了多学科的实质性交叉融合。2008年3月20日，《健康报》头版头条发表《吹响学科集结号》的长篇通讯，把这一创新推向了全国。

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