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于浩澎
简介
于浩澎,男,汉族,九三学社社员,理学博士,副研究员,硕士生导师,现任中国医疗保健健康数据和数字医学分会委员、四川省生物信息学会委员、四川省国际医学交流促进会委员。 先后主持国家自然科学基金青年基金、四川省重点研发面上项目,骨干参研国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目等国家、部、省级重大科技项目6项。以通讯或第一作者在Cell Stem Cell、Nature Communication、eLife等国际著名学术期刊发表SCI论著10余篇(IF>20有4篇), 荣获2023年第三季度“Wiley威立中国开放科学高贡献作者”。揭示了相分离可通过调控染色质三维结构重组促进细胞命运转变的机制,被nature structural & molecular biology评为2021年度全球生命科学领域十二大关键研究进展。主持研发大规模多组学数据并行加速分析平台,将人类全基因组分析时间从24小时缩短至7分钟,突破了基因分析加速的“卡脖子”技术,获央视新闻专题报道,入选国家“十三五”科技创新成就展,获评“华西医工十大进展”。
联系邮箱: yuhaopeng@wchscu.edu.cn
研究方向:
表观遗传、染色质生物学和多组学智能医学
研究成果
项目基金:
1.国家自然科学基金青年基金项目,32100927,ATF3通过调控增强子的活性及互作促进尿酸性肾病纤维化的机制研究,2022/01-2024/12, 30万元,在研,主持
2.四川省科技厅重点研发面上项目,2021YFS0158,基于启动子增强子互作的高尿酸血症肾损害保护性因子筛选与调控机制研究,2021/01-2022/12, 20万元,在研,主持
3.华为技术有限公司/赛乐基因科技(北京)有限公司,多组学数据加速分析平台系统的研发,HX20210351,2021/3-2022/4,40万元,在研,主持
4.国家重点研发计划,2017YFA0102801,人多能干细胞自我更新和分化的DNA-组蛋白-RN A互作网络分析,2017/07-2021/12, 1334万元,完成,参加
文章发表
(1) Wang, J.*, Yu, H.*, Ma, Q.*, …, Zhang, W., Miao, Y., Ding, J. Phase separation of OCT4 controls TAD reorganization to promote cell fate transitions. Cell Stem Cell, 2021, S1934-5909(21)00181-8 (封面文章,IF=25.9,被nature structural & molecular biology评为2021年度关键研究进展,分别被Carolina N. Perdigoto主编在nature structural & molecular biology和裴端卿教授在Cell stem cell长篇评论)
(2) Sun J., Qu J., Zhao C., …, Yuan Y.#, Fan L.#, Yu, H.#, Ding J.# Precise prediction of phase-separation key residues by machine learning. Nat Commun, 2024, 26;15(1):2662. (IF=17.7)
(3) Yang,Y.*, Li, Y.*, Yu, H. *, … Yuan, Y#. Comprehensive landscape of resistance mechanisms for neoadjuvant therapy in esophageal squamous cell carcinoma by single-cell transcriptomics. Signal Transduct Target Ther, 2023, 8, 298. (IF=39.3)
(4) Liu, X., Wu, J., ..., Yu, H. #, Dong, B.# Prevotella copri alleviates sarcopenia via attenuating muscle mass loss and function decline. J Cachexia Sarcopenia Muscle, 2023. (IF=11.3)
(5) Cheng, D.*, …, Yu, H. #, Zhao, Y#., Ren, J.# Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma. eLife, 2023, 12:e82705. (IF=7.7)
(6) Yu, H.*, Tian, C.*, Yu, Y. Jiao, Y., Transcriptome survey of the contribution of alternative splicing to proteome diversity in Arabidopsis thaliana. Mol Plant, 2016, 9(5):749-52. ( IF: 27.5 )
团队专利
一种多模态组学数据管理系统,...
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