神经疾病中心涵盖神经外科及神经内科专业。

神经内科长期与华西医院本部神经内科按照一体化管理模式运行，依托脑血管疾病、癫痫及发作性疾病、神经遗传变性疾病、神经感染及免疫性疾病四个稳定的专业发展方向及华西医院先进的诊治设备和多学科交叉优势，以病人为中心，以医疗安全与质量为目标，紧密围绕"提高医疗服务能力和水平"主题开展医疗工作，为广大患者提供优质的医疗服务和神经系统疾病循证诊断与治疗。目前神经内科已有脑血管疾病、癫痫与发作性疾病、运动障碍疾病、神经感染及免疫、脱髓鞘与脊髓疾病、认知功能障碍疾病、周围神经与肌肉疾病、脑病以及神经系统疾病重症与疑难杂病专业等多个亚专业。共有二个病区，总床位100张，病床使用率达到100-120%，年门诊量超3万人次，年出院患者近四千人次，月出院患者320人次左右。脑血管亚专业骨干成员分别担任四川省学术和技术带头人、中华医学会神经病学分会常委、神经生化组副组长、中国卒中学会常务理事、四川省康复医学会神经康复技术专委会委员、四川省卒中学会介入分会青年委员会委员，主持国家重点研发计划“十三五重点专项”、国家自然基金项目、科技部“十一五”、“十二五”支撑计划、省科技厅攻关项目等。致力于推广和实施脑卒中循证诊治的规范化理念和个体化原则，基本形成科研指导临床医疗实践，临床医学实践促进科研发展的良好局面。有完善的高级与综合卒中中心体系，为挽救脑卒中患者生命、降低残疾开辟“绿色通道”。构建了适合西南特别是民族地区慢性疾病双联双通防控结合协作网络和管理新体系，我科与康复科、营养科一起开展脑卒中多学科联合诊疗，为患者提供个性化、连续性、高质量的诊疗服务。癫痫及发作性疾病亚专业骨干成员先后承担国家自然科学基金、国家“九五”、“十五”攻关及省部级课题多项，任职于中华医学会神经专委会癫痫与脑电图学组委员、中国医师协会神经内科分委会委员、四川省医学会神经专委会委员等，获得全国吴阶平医学奖、卫生部科技进步奖、四川省科技奖一等奖、四川省学术和技术带头人、中国医师协会杰出神经病学青年医师奖等。亚专业组主要立足于癫痫及其他非癫痫的发作性疾病（如发作性晕厥、抽搐、头晕、行为异常等）的诊疗。神经变性病专业组骨干成员任职于中华医学会神经病学分会第七届委员会神经遗传学组委员、中华医学会神经病学分会第八届委员会肌电图与临床神经生理学组委员、中国微循环学会神经变性病专业委员会常委委员等，主持国家自然科学基金多项，常年致力于神经变性病，包括帕金森病、运动神经元病、多系统萎宿、亨廷顿舞蹈病、遗传性痉挛性截瘫、肌张力障碍等的基础、临床、影像学研究。神经感染及免疫疾病专业组骨干成员任职于中华医学会神经病学分会神经免疫学组委员、中华医学会免疫分会神经免疫性组委员等，主持国家自然科学基金，发表SCI论文数十篇，涉及病毒性脑炎、结核性脑炎、免疫性脑炎、神经梅毒、多发硬化、视神经脊髓炎谱系疾病、重症肌无力、格林巴利综合征等病种，将临床诊治与基础研究相结合，熟练掌握其诊断、鉴别诊断、药物治疗等，为神经感染及免疫疾病患者提供更好的治疗。神经内科拥有一支稳定、雄厚及有影响的学术梯队，现有医师13人，包括博士研究生导师1人，硕士研究生导师3人，高级职称5人，中级职称5人，初级职称3人，其中博士、硕士研究生占比达85%。护理人员36人，包括主管护师 4人，护师 23 人，其中硕士研究生1人，本科32人。多名医师先后在美国、日本、瑞士、德国等著名大学留学或研修。数名医师在中华医学会、中国医师协会、四川省医学会、成都市医学会、高新区医学会等组织中任职，并担任多个专业期刊常委、编委及委员。神经内科主编、参编专著数十本，每年发表专业论文数十篇，现有国家、省部级项目近10项，科研经费200余万元。神经内科承担各级继续教育项目，负责进修医师、研究生、住院医师、实习医师等各类人才的培养。

神经外科成立于2012年5月，是医院最早建立的专科之一，经过近10年时间的建设，在历届院领导和科室主任的不懈努力下，已发展成为西部地区排名前列的神经疾病诊治中心。科室现有120张床位，高级职称11人，11个医疗组，年手术量逾2400台，神经外科用于评价收治疾病疑难危重度的CMI指数在四川省各医院中排名第一（具体数据），涉及功能、血管、颅底、脊柱、胶质瘤、颅脑创伤修复和小儿神经疾病等领域，先后在上锦分院开展多项临床诊疗新技术，在手术机器人精准定位切除重要功能区病变及脑活检、闭环VNS植入治疗复杂难治性癫痫、球囊压迫治疗三叉神经痛、巨大复杂颅内动脉瘤和脑血管畸形的综合治疗、脊髓肿瘤和脊柱退行性病变的微创治疗、脑干病变的微创治疗、颅底巨大难治性病变的MDT手术、脑胶质瘤的术中唤醒技术、小儿复杂病变的诊疗和全程管理、重型颅脑损伤的救治、外周神经损伤的修复重建等方面在行业内处于领先地位。