天府科技园代谢与蛋白组学平台位于天府生命科技园B2栋5楼A区,平台以液质联用技术为核心,为临床蛋白质组和代谢组学研究服务,助力疾病早期筛查、机理研究、药物靶点发现等。平台位于园区B2栋5楼A区,已配备4台液相质谱仪及其专属实验技术人员,同时配备专职生物信息学技术人员2名,平台研究人员为全球抗新冠质谱联盟成员。平台重点针对各类临床样本,开发和优化了系列样本前处理方案及色谱、质谱检测方法,可提供实验设计、样本前处理、上机检测、数据质控和可视化分析等全流程技术支撑
1)蛋白组学技术服务
定性分析:蛋白质全谱分析;蛋白纯品、蛋白胶条、CO-IP复合物鉴定;
定量分析:iTRAQ/TMT、二甲基标记定量;非标记定量;靶向蛋白质定量;
修饰分析:蛋白质的磷酸化、糖基化、甲基化等修饰位点分析。
样本类型:细胞及其亚组分、组织、血液、尿液、脑脊液等常见临床样本。常规蛋白质组学分析流程。
注:全流程中样本前处理和数据分析操作步骤较多耗时较长;标记定量蛋白质组学需要上机检测前进行额外得同位素标记和肽段分级流程;修饰蛋白质组需要在肽段或蛋白层面利用抗体或亲和材料对修饰组分进行额外富集,需要研究者共同参与优化富集条件。
2)代谢组学/脂质组学技术服务
非靶向代谢组学:水溶性代谢组学分析;脂质组学分析;目标小分子化合物分析:靶向代谢组学分析;氨基酸、维生素及激素分析;其它特定小分子化合物定性定量分析。
3)数据分析服务
组学单元与多元统计分析、蛋白质及代谢物功能注释富集及通路分析
4)设备展示
(一)纳升液相联三合一超高分辨率质谱仪 Thermos fusion Lumos
本设备具有高达500,000 FWHM分辨率的orbitrap检测器与双压线性离子阱检测器并联结构,配备超高压纳升色谱系统及多种数据处理平台,具有优异的蛋白质组学分析覆盖度和准确性,能满足DDA、DIA、PRM、de novo等多种分析模式。主要用于蛋白质组学的标记及非标记定性、定量分析和翻译后修饰分析。
(二)超高效液相联飞行时间高分辨质谱仪 waters SYNAPT G2-Si HD本设备为四级杆检测器串联飞行时间检测器高分辨质谱,其四极杆串联飞行时间检测器可以保证大于60,000 FWHM的仪器分辨率,且不受采样速率影响。 MS及MS/MS模式下质量精确度均小于1 ppm。仪器配备Waters Acquity H-class超高效液相色谱仪,可实现对小分子化合物的高效分离与检测;配备离子淌度,可实现化合物同分异构体的有效鉴别;另有DESI离子源可实现对切片样本的质谱成像。主要用于代谢组学非靶向及靶向定量及定性分析、质谱成像研究等。
(三)超高效液相联三重四级杆质谱仪 AB SCIEX QTRAP 5500
该设备配备Turbo V离子源和LINAC碰撞池,其三路雾化气技术、 最高750°离子源温度技术确保离子化效率高、灵敏度高、通量高等特点,同时带有线性离子阱定性功能、离子淌度技术模块,能满足定量和定性功能的完美结合以及实现淌度的三维分离模式。主要用于代谢组学和脂质组学靶向分析、药物药代动力学研究、药物代谢产物相对定量和绝对定量。
(四)超高效液相联三重四级杆质谱仪 AB SCIEX Triple QuadTM 6500+
本设备结合了lonDrive技术,从离子源到离子聚焦区域,再到全新的高能检测器,通过增加离子的产生,提升离子的传输效率以及改善离子的检测效率,显著提高仪器的灵敏度。同时,三路雾化气技术、 最高750°离子源温度技术进一步确保离子化效率高、灵敏度高、通量高等特点。该仪器主要用于广靶向代谢组学分析(包含氨基酸及其代谢物、有机酸及其衍生物、核苷酸及其代谢物、三羧酸循环、激素、胆汁酸等)、靶向代谢组学定量分析(常规血浆、细胞、组织样本等)。
平台主管:龚萌/杨浩
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