华西医院是中国重要的医学科学研究和技术创新的国家级基地。
在中国医学科学院医学信息研究所发布的“中国医院科技影响力排行榜”上，连续6年排名全国第一；
在复旦大学中国最佳医院排行榜上，科研得分连续10年名列全国第一；
专利申请及授权数在全国医疗机构中连续11年排名第一；
发表科技论文在全国医疗机构中长期名列前茅，被SCI收录的论文数在全国医疗机构中连续12年排名第一，
“表现不俗”论文数连续10年排名第一。
在Nature INDEX排行榜上，名列全球第26位，中国第一位；
临床医学ESI排名进入全球前1‰；
是我国首批唯一入选“2011协同创新计划”生物医药类项目的牵头单位。

1986年以来，学院/医院逐步明确并持续推进“科技强院”的发展战略，瞄准解决临床问题的医学前沿科技、关系国计民生的重大国家项目和代表医学发展的重大目标；加强学科建设，建设研究转化大平台，培育科技创新大团队；使我院的科技能力逐步从西部异军突起、持续发展，处于全国医学科技领域的前列位置，同时取得了建院历史以来的科学研究最好成绩。