医学信息学是研究如何有效利用医学相关信息的一门学科。它是临床医学与现代信息科学、计算机技术、数理统计、医院管理和医学情报等多学科交叉融合而产生的以提高医疗效力、效果和效率，降低医疗花费，合理配置医疗资源，改善人群健康为目的的新兴交叉科学。
 
  我院医学信息学学科点为全国第一个临床医学下设置的医学信息学博士点(2006年)，从2008年开始面向全国招生。医学信息学学科是一个依托华西临床医学院/华西医院，联合四川大学华西第二医院、华西口腔医院、华西公共卫生学院、计算机学院、数学学院、网络空间安全学院以及建筑与环境学院等的交叉创新型研究与教学平台。
 
  本学科以病人为中心开展医学信息研究，指导有志于医学信息学学科发展的同仁开展医学信息工作，传播医学信息知识，提升医疗与健康管理质效；旨在培养能综合运用医学、计算机科学、数理统计、管理学和信息学知识的应用型、复合型高级人才。要求毕业生具备对医学数据的挖掘、分析与管理能力，主要从事的工作包括：从大量医学信息中发现潜在规律，提供决策支持；开展信息服务与知识管理；开发信息资源与建设信息系统；医学信息学知识转化与相关产品研发等。
 
  目前主要研究方向：医学信息与医院管理、医学数据挖掘与人工智能、医学影像信息学、临床与转化生物信息学。