预约
挂号
联系
我们
就诊
指南
常见
问题
返回
顶部
请输入关键字
临床微生物实验室全面自动化结合排班优化有效缩短脑脊液培养TAT 2022.01.26

微生物耐药已经成为全球公共健康领域面临的一项重大挑战,受到联合国、世界卫生组织和多国政府的高度重视。国家卫生健康委2021年10月印发《“提高住院患者抗菌药物治疗前病原学送检率”专项行动指导意见》,以提高抗菌药物使用的合理性和规范性、提升医疗安全和质量为目标,在加强微生物专业能力建设、重点关注无菌部位标本微生物培养送检、提升检验的时效性和准确性上提出明确要求。

一直以来,微生物检验具有样本类型多、流程复杂、手工操作繁琐等特点,导致耗时长、自动化程度低、样本追踪不便,限制了其价值的及时发挥。随着时代发展与技术革新,微生物检验自动化在经过漫长的技术迭代更新后应运而生。我科临床微生物实验室在2019年11月引入全自动微生物流水线(BD Kiestra TLA),于2020年3月正式启用,为东亚地区首套全面投入临床应用的TLA流水线,实现了从样本接收到平板丢弃的全流程自动化。同时,微生物流水线在加样、平板划线及平板监控采用封闭式流程,配备高效过滤器以及生物安全柜,并结合数字化影像工作站阅板,减少人员曝触高污染性平板的风险,在疫情期间,大幅提升实验室环境及人员操作的安全性。

为充分利用TLA连续接收、定时拍照和电脑屏幕读取图像的优点,华西医院实验医学科临床微生物室调整阅板处理和报告审核岗位的排班由原来的一班制(白班)到三班制(早班、白班和晚班),在不增加实验室人员数量的条件下,增加阅板的频次,快速筛选阳性培养并进行后续次代培养、鉴定、药敏和报告审核工作,从而缩短培养阳性标本的实验室周转时间(TAT,Turnaround time)。


提取我科临床微生物实验室在TLA使用前(2019年7月至12月)和TLA使用后(2020年7月至12月)的实验室数据进行分析和评估,使用Mann-Whitney U检验和Kruskal-Wallis检验比较TLA使用前后的TAT变化,主要研究结果如下(文章链接参见文末):


1. TLA使用前后样本接收和最终结果报告的时间分布

样本接收

TLA使用前,从早上9点到下午5点,有两个接收高峰。TLA使用后,整个时间段曲线更加平缓,原因在于TLA能自动连续或者随机执行样本接收、划线和孵育工作,而不再限制于分批次处理模式。

  结果报告

TLA使用前,药敏报告审核主要从早上8点开始进行,每天仅1个高峰。TLA使用后,由于增加了早班(提前无菌部位阳性样本的药敏上机时间)和晚班(增加一次晚间报告审核),在晚上8点出现一个小的报告高峰,从而缩短TAT时间达12小时,意味着临床医生在夜班或早查房之前就能读取药敏报告,更早获得精准的抗菌药物治疗建议,从而及时调整治疗方案。

2.TLA使用前后不同样本类型TAT

通过对29199 例培养阳性样本 (Pre-TLA:14956,Post-TLA:14243 ) 进行分析,相较于TLA使用前,所有类型阳性培养样本平均TAT明显降低了2.4个小时(65.93 vs 63.53)。

不同类型的阳性培养样本TAT降低的程度不相同,其中脑脊液TAT降低最为显著,达22.46小时(86.76 vs 64.3),其次是痰液(64.38 vs 61.41)、尿液(52.1 vs 49.57)和血液(68.49 vs 66.6)。需要指出的是,本研究的TAT终点是药敏终报告时间,而晚班的药敏报告审核主要以初步报告为主,如果纳入初步报告的时间节点进行分析,各样本的TAT将会有更明显的缩短。



****P < 0.0001; **P < 0.01; *P < 0.1; ns, no significance.

3. TLA使用前后脑脊液样本仅肉汤生长的发生率

为什么脑脊液标本的TAT变化如此明显?研究进一步分析了脑脊液培养的实验室流程和TAT的关系。脑脊液培养流程会同时接种营养琼脂平板和增菌肉汤管,当平板培养阴性,肉汤培养阳性时,肉汤需要转种至平板上,待平板上细菌生长之后再进行下一步鉴定和药敏试验,因此TAT时间会延长至数天。对脑脊液培养的结果分析显示:TLA使用前,脑脊液标本仅肉汤生长(营养琼脂平板未生长)的发生率为12.4%(14/133);TLA使用后,仅肉汤生长发生率降低至3.4%(4/119),这意味着TLA大大提高了实验室以脑脊液为代表的无菌体液培养效率。分析原因为:一是TLA的使用缩短了从样本接种到放置于孵箱之间的等待时间;二是智能孵箱不必随时开关,培养条件更恒定均一。当去掉仅肉汤生长的样本后,脑脊液阳性样本TAT差异从22小时缩短至7小时。

4. TLA使用前后脑脊液分离的菌株分布

脑脊液样本常见分离株为新生隐球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌,分别占20.8%、18.5%、13.1%和8.3%。TLA使用前后的菌种分布和分离率比较无统计学差异,有待补充数据后进行进一步分析。


临床微生物实验室作为感染诊防治体系建设中的重要一员,尽可能缩短样本检测TAT,提供快速准确的药敏报告,帮助临床及时调整经验性广覆盖治疗为精准靶向治疗,对于抗菌药物合理使用、遏制微生物耐药具有重要作用。微生物全自动流水线TLA的使用提高了培养效率和阳性率,在脑脊液培养中表现得尤为突出。我科在引入TLA的基础上,结合实验室工作班制的优化调整,有效缩短了培养和药敏报告的TAT,使病人能够更及时地接受精准的抗菌药物治疗,从而降低住院成本和死亡率。在人才培养和人力资源分配方面,流水线可以取代重复性高的人力工作,让微生物专家将更多的精力投入到报告解读和疑难感染的诊断中,与临床进行更紧密的沟通合作,为患者提供更优质的医疗服务。


文章链接:

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2021.765504/full




作者:张为利,肖玉玲 来源:实验医学科
基本信息填写
您的姓名:
联系方式:
电子邮箱:
问题类型:

select…

  • 内容无法访问
  • 信息不更新
  • 内容不准确
  • 错别字
  • 图片不准确
  • 其他
问题页面网址:
问题描述:
验证码: