2005年12月6日，中国科学技术信息研究所召开“第13届中国科技论文统计结果发布会”，公布了2004年度中国科技论文统计结果。在2004年SCI收录论文数排名中，我院以41篇在医疗机构中排名第四；在2004年国内论文数排名中，我院以1390篇在医疗机构中排名第四；在2004年国内论文被引用次数排名，我院以1857次在医疗机构中排名第八；在2004年度国内和国际论文总数较多的医疗机构排名中，我院以1440篇排名第四；在医学类科技论文高产机构排名中，四川大学以212篇排名第二。
    科研论文是科技产出的重要指标之一，也反映了科研机构的科研水平。中国科学技术信息研究所发布的“2004年度中国科技论文统计结果”中，国际论文数据主要取自国际上颇具影响的检索工具《科学引文索引》（SCI）、《工程索引》（EI）和《科学技术会议录索引》（ISTP），今年新增加了对美国《医学索引》（MEDLINE）的统计分析。国内论文数据取自中国科学技术信息研究所研制的《中国科技论文与引文数据库》（CSTPCD），该数据库2004年度收录的中国科技论文统计源期刊共1608种。