1937年毕业生、仁济医院医生罗盛昭领导的中国红十字总会救护队驰骋数万里，救治受伤军民12万余人。1938年1月27日《大陆晚报》发表社论，赞美罗为“模范医生”。 其后在陆军第七十二军任军医处长，抗战胜利后获光华甲种一等奖章。此外，在红会的还有1938年毕业生吴崇福；在30集团军的有1936年毕业生李光祖和1943年毕业生李辉祖；在27集团军的有1931年毕业生杨正萱；1933年毕业生何有信在国联防疫总队任队长。

1939年5月，“五大学战时服务团”发起成立了防护大队，中大解剖学教授张查理任防护大队长，由医学院教师讲授防毒、包扎等急救知识并进行了演习。

1939年6月11日，日军轰炸机对成都南部地区进行了狂轰乱炸。“五大学战时服务团”防护队员赶往现场救护伤员，华西事务所过道走廊成为伤员的临时住所，重伤员则用担架送往“三大学联合医院”抢救治疗。

1944年，日军进占武汉、贵州，政府在知识青年中开展“青年从军运动”，钱穆发表文章，鼓励学生从军，五大学从军抗日的热情高涨。医学院学生曹振家再次投笔从戎，在王耀武的军部队任外事处上校联络官。王浴生、袁绍沄等参加了远征军赴滇缅战场，在缅的华西同学还组成了校友会。

1945年8月23日，今井武夫代表日本政府在湖南芷江向中国政府和在中国大陆作战的盟军签字投降，“芷江受降”标志日本侵华战争结束。